בעיית הכחדתם של בעלי חיים מסוימים אינה המקום האחרון בתורת האבולוציה והיא חשובה ביותר בתורת דרוויניאן. מספר המינים החיים בתקופה הנוכחית תופס רק חלק לא מבוטל ממספר החיות הכולל שהופיעו אי פעם על כדור הארץ (פחות מ -1%). 99% מהקטגוריות סוף סוף נפטרו, ויש לכך הרבה סיבות.
הרגישים ביותר להכחדה הם בעלי חיים שנמצאים במקום אחד או יותר באזורים מוגבלים גיאוגרפית. אם כל הטווח עבר פעילות אנושית, אז המינים החיים בו עלולים להיעלם. הסיבה הישירה להכחדתם של סוגים מסוימים של בעלי חיים בתנאים טבעיים היא ירידה במספרם מתחת לרמה הקריטית, הנקבעת על פי חוקי הגנטיקה של האוכלוסייה. קריטית היא רמת השפע, שמתחתיה הופכת האפשרות למעבר קרוב זה לזה גדולה, מה שמוביל לירידה במגוון הגנטי של המינים. כתוצאה מכך יש שיעור צאצאים עם הפרעות מולדות המגבירים את התמותה בדורות חדשים. מינים שנוצרו כתוצאה מאוכלוסייה אחת או יותר נתונים גם להכחדה מהירה. כל קטגוריה יכולה להיעלם כתוצאה משריפות, רעידות אדמה, מחלות ופעילות אנושית. קטגוריות עם אוכלוסיות שונות פחות נוטות להכחדה, בהשוואה לאלה הקטנה, לבעלי חיים גדולים יש שטחים עצומים עצומים. הם זקוקים להרבה אוכל, ולעיתים קרובות הם הופכים לטרף לבני אדם. בעלי חיים גדולים רגישים יותר להשמדה, לא רק בגלל שהם טרף, אלא גם בגלל שהם מתחרים בבני אדם בחיפוש אחר ציד, לפעמים תוקפים אנשים ובעלי חיים. יש אוכלוסיות של בעלי חיים הניזונים משטחים גדולים. הם גם נוטים להכחדה, בתנאי שחלק מהטווח שלהם נהרס. עם ההתפתחות הטבעית של הטבע, שינויים סביבתיים מכריחים כמה קטגוריות להסתגל לתנאים חדשים. בעלי חיים שאינם מסוגלים להסתגל נאלצים לנדוד לבית גידול מתאים. אחרת, המין שלהם מאוים בהכחדה. קצב ההתפתחות המהיר של משאבי הטבע עולה על ההסתגלות, ומשאיר את ההגירה כאופציה היחידה. קטגוריות של בעלי חיים שלא יכולים לחצות שדות, כבישים ובתי גידול משובשים אחרים נידונו להכחדה. תועלתנות הייתה תמיד תנאי הכרחי להכחדתם של בעלי חיים בעלי ערך רב. ניצול יתר יכול להפחית באופן דרסטי את גודל האוכלוסייה. אם הציד אינו מוסדר בחוק, אזי סוגים מסוימים של בעלי חיים עשויים להיות על סף הכחדה.
